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スケール変換したエントロピーサンプリング法によるペプチド分子の構造予測
http://hdl.handle.net/11478/00001616
http://hdl.handle.net/11478/0000161623dd3eab-22d8-49af-8a14-44bcceec72d9
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
34(2)-189.pdf (368.8 kB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2021-02-08 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | スケール変換したエントロピーサンプリング法によるペプチド分子の構造予測 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | Prediction of peptide conformation using a scale-transformed entropic sampling algorithm | |||||
| 言語 | en | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Scale Transformation | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Entropic Sampling | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Global Optimization | |||||
| キーワード | ||||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Met-enkephalin | |||||
| キーワード | ||||||
| 言語 | en | |||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Scale Transformation | |||||
| キーワード | ||||||
| 言語 | en | |||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Entropic Sampling | |||||
| キーワード | ||||||
| 言語 | en | |||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Global Optimization | |||||
| キーワード | ||||||
| 言語 | en | |||||
| 主題Scheme | Other | |||||
| 主題 | Met-enkephalin | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
| 著者 |
中村, 秀昭
× 中村, 秀昭 |
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| 著者(ヨミ) | ||||||
| 識別子Scheme | WEKO | |||||
| 識別子 | 3072 | |||||
| 姓名 | ナカムラ, ヒデアキ | |||||
| 別言語の著者 | ||||||
| 識別子Scheme | WEKO | |||||
| 識別子 | 3132 | |||||
| 姓名 | NAKAMURA, Hideaki | |||||
| 内容記述 | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | A scale-transformed entropy sampling algorithm for searching a conformational energy space of polypeptides is presented. This algorithm is based on the assumption that high energy barriers can be overcome by a uniform sampling of the logarithmically transformed energy space. This algorithm is tested with Met-enkephalin, a peptide with a known global minimum structure. Using a new Monte Carlo sampling method, energy barriers of 3000 kcal/mol are frequently overcome and, therefore, many minima are searched more efficiently than with the usual entropy sampling simulations. This method can be utilized as the optimization algorithm. The global minimum conformations obtained in optimizations agree well with those obtained by the simulated annealing (SA) method and by the systematic stepsize variation (SSV) method. The entropy, the average energy and the specific heat are estimated with one Monte Carlo run. | |||||
| 書誌情報 |
福岡工業大学研究論集 en : RESEARCH BULLETIN OF FUKUOKA INSTITUTE OF TECHNOLOGY 巻 34, 号 2, p. 189-194, 発行日 2002-03-15 |
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| ISSN | ||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||
| 収録物識別子 | 02876620 | |||||
| フォーマット | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | application/pdf | |||||
| 著者版フラグ | ||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||
| タイトル（ヨミ） | ||||||
| その他のタイトル | スケール ヘンカン シタ エントロピーサンプリング ホウ ニヨル ペプチド ブンシ ノ コウゾウ ヨソク | |||||
| 出版者 | ||||||
| 出版者 | 福岡工業大学 | |||||
| 出版者（ヨミ） | ||||||
| 値 | フクオカ コウギョウ ダイガク | |||||
| 別言語の出版者 | ||||||
| 値 | Fukuoka Institute of Technology | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 論文(Article) | |||||
| 資源タイプ・ローカル | ||||||
| 値 | 紀要論文 | |||||
| 資源タイプ・NII | ||||||
| 値 | Departmental Bulletin Paper | |||||
| 資源タイプ・DCMI | ||||||
| 値 | text | |||||
| 資源タイプ・ローカル表示コード | ||||||
| 値 | 02 | |||||
